コミックマーケット準備会は12月20日、2021年5月2日から5日の開催を予定していたコミックマーケット99の開催日を1日短い、5月2日〜4日の3日間の開催に変更することを明らかにした。
開催日を発表した後も準備会では運営方法を継続的に協議しており、COVID-19（新型コロナウイルス感染症）や会場を取り巻く状況の変化、さらにはさまざまな事情により参加の難しい準備会スタッフが相当数見込まれることなどを総合的に判断し短縮を決めた。
日程変更に伴い、ジャンルごとの割り振りが変更になっている。都合が悪くなった参加者についてはキャンセルを受け付けている。
COVID-19感染拡大の影響で、2020年GWのコミックマーケット98は開催中止に。12月に予定していたコミックマーケット99は開催延期となるなど、厳しい状況が続いている。
会場となる東京ビッグサイト
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